Hem MOC'ler hem de MOF'ler metal-organik koordinasyon bağları içerse de temel farklılıklar vardır:
Boyutsallık: MOC'ler 0 boyutlu ayrı moleküllerdir, MOF'ler ise 2B veya 3B sonsuz şekilde genişletilmiş ağlardır.
Çözünürlük: Çoğu MOC çözünürken, MOF'lar genellikle çözünmez.
Kararlılık: MOF'lar genellikle daha yüksek termal kararlılığa sahiptir.
Uygulama odağı: MOC'ler moleküler tanıma konusunda üstündür, MOF'lar ise gaz depolama için daha uygundur.